XVII a. pr. į Kauną atvykusioms vienuolėms bernardinėms Kauno maršalka A. Masalskis būsimam vienuolynui kurti nupirko kelis namus. Iki 1634 m. pastatė bažnyčią su vėlyvojo renesanso ir gotikos bruožais - smailiaarkių langų formomis, kontraforsais, tinkliniais skliautais. Pastatas halinio tūrio, 3 navų. Fasade simetriškai sukomponuotos renesansui būdingos nišos su apvadais. Į bažnyčią patenkama pro įėjimą esantį bokšte. Po gaisrų interjeras įgavo barokines formas, įrengti devyni altoriai. 

Vienuolynas. Puošnūs manieristinės architektūros centriniai rūmai, kurių frontonas primena Nyderlandų renesanso pastatus, yra vienas gražiausių Lietuvoje. Frontone dominuoja horizontalios linijos, o trys tarpsniai vertikaliai skaidomi piliastrais ir nišomis. Vienuolyno pirmajame aukšte buvo įrengta virtuvė ir valgomasis, puošni salė, antrajame aukšte - vienuolyno vyresniosios kambarys ir celė. Dabar pastatų komplekse veikia Kauno kunigų seminarija.